Động vật hoang dã Bến En phải kể đến gấu ngựa, voọc má trắng, vượn đen, sói đỏ, phượng hoàng đất, gà tiền mặt vàng. Khoảng 3000ha hồ sông mực hồ nước sâu, nước trong xanh, sóng lặng, có ba ba, có các loài cá, đặc sắc là cá mè nặng tới 50 kg thịt trắng và thơm, dầy mỡ. 

Vườn quốc gia Bến En có nhiều sinh vật quí. Về thực vật tại đây có 58 loài có trong danh lục đỏ IUCN 2013, 46 loài có tên trong sách đỏ Việt Nam năm 2007 và 10 loài có tên trong Nghị định 32/2006/NĐ-CP như Lim xanh, lát hoa, chò chỉ, trai lý, Vù hương... Về động vật có 56 loài được ghi trong sách đỏ Việt Nam 2007, 433 loài trong danh lục IUCN 2013, 50 loài trong Nghị định 32/2006/NĐ-CP như: Vượn đen má trắng, Culy lớn, Culy nhỏ, Gà lôi, Gấu.... Phong cảnh của vườn quốc gia Bến En đầy thơ mộng. Hồ sông Mực rộng 3.000ha với hơn 21 hòn đảo và bán đảo lớn nhỏ. Nhiều hang động nhũ đá lung linh huyền ảo ẩn chứa các hang động như hang Ngọc, Động Tiên...

Đến với vườn quốc gia Bến En, du khách có dịp tìm hiểu, nghiên cứu về các loài động thực vật quí hiếm ở đây, sống giữa rừng đại ngàn nghe chim kêu vượn hú thâu đêm, nướng cá bên khe suối... thật thú vị. Trong tương lai Bến En sẽ trở thành một khu du lịch hấp dẫn.